On trouve trace du nom de Bourdonné sous des formes multiples : Burdinaco, Bourden, Bourdonnay, Bourdenet… . Ce nom doit signifier « près du bord » (de la rivière ou de la forêt).

Il fait partie, déjà, à l’époque mérovingienne, des « Yvelines », vaste région très humide, dont le nom signifie d’ailleurs « abondante en eaux ».